Konsultansi dan pendampingan diberikan kepada mitra PSEKP UGM terkait dengan masalah-masalah ekonomi dan kebijakan publik. PSEKP UGM menjalin kerjasama dengan berbagai lembaga baik nasional maupun internasional.
Kerjasama dalam negeri antara lain dengan: 1. Bank Indonesia, 2. Bappenas, 3. Kementerian Keuangan, 4. Kementerian Dalam Negeri, 5. Kementerian Lingkungan Hidup dan Kehutanan, 6. Kementerian Pendidikan dan Kebudayaan, 7. BATAN, 8. BRR NAD-Nias, 9. Kementerian Perindustrian, 10. Kementerian Agama, 11. Kementerian Desa, Pembangunan Daerah Tertinggal, dan Transmigrasi, 12. Bulog, dan 13. Pemerintah Provinsi/Kabupaten/Kota di seluruh Indonesia.
Sementara itu kerjasama dengan pihak swasta dilakukan antara lain dengan: 1. PT. Bank Mandiri, 2. PT. Bank Tabungan Negara, 3. PT Edecon Primamandiri, 4. PT. Pelindo II Jakarta, 5. PT. Pelindo III Surabaya, 6. PT PLN (Persero), 7. PT Sucofindo-Jakarta, dan 8. PT Asuransi Jiwasraya.